Με την ενσωμάτωση στον Οργανισμό Φυσικού Περιβάλλοντος και Κλιματικής Αλλαγής του Φορέα Διαχείρισης Κάρλας – Μαυροβουνίου – Κεφαλόβρυσου Βελεστίνου – Δέλτα Πηνειού, η Μονάδα Διαχείρισης Προστατευόμενων Περιοχών Θεσσαλίας λειτουργεί με έδρα την Καλαμπάκα και παράρτημα τα Κανάλια Μαγνησίας.
Η Μ.Δ. υπάγεται στην Διεύθυνση Διαχείρισης Προστατευόμενων Περιοχών (Τομέας Α) της Γενικής Διεύθυνσης του Ο.ΦΥ.ΠΕ.Κ.Α.
Η χωρική της αρμοδιότητα περιλαμβάνει τους Κωδικούς Προστατευόμενων Περιοχών ως εξής:
| GR1410001 | ΠΕΡΙΟΧΗ ΛΙΜΝΗΣ ΤΑΥΡΩΠΟΥ |
| GR1410002 | ΑΓΡΑΦΑ |
| GR1420004 | ΚΑΡΛΑ – ΜΑΥΡΟΒΟΥΝΙ – ΚΕΦΑΛΟΒΡΥΣΟ ΒΕΛΕΣΤΙΝΟΥ – ΝΕΟΧΩΡΙ |
| GR1420006 | ΟΡΟΣ ΜΑΥΡΟΒΟΥΝΙ |
| GR1420009 | ΣΤΕΝΑ ΚΑΛΑΜΑΚΙΟΥ ΚΑΙ ΟΡΗ ΖΑΡΚΟΥ |
| GR1420010 | ΣΤΕΝΑ ΚΑΛΑΜΑΚΙΟΥ |
| GR1420011 | ΠΕΡΙΟΧΗ ΘΕΣΣΑΛΙΚΟΥ ΚΑΜΠΟΥ |
| GR1420012 | ΠΕΡΙΟΧΗ ΦΑΡΣΑΛΩΝ |
| GR1420013 | ΠΕΡΙΟΧΗ ΤΥΡΝΑΒΟΥ |
| GR1420014 | ΠΕΡΙΟΧΗ ΕΛΑΣΣΟΝΑΣ |
| GR1430001 | ΟΡΟΣ ΠΗΛΙΟ ΚΑΙ ΠΑΡΑΚΤΙΑ ΘΑΛΑΣΣΙΑ ΖΩΝΗ-ΣΠΗΛΑΙΑ ΜΑΛΑΚΙ ΚΑΙ ΣΕΠΟΝΙ |
| GR1430002 | ΚΟΥΡΙ ΑΛΜΥΡΟΥ- ΑΓΙΟΣ ΣΕΡΑΦΕΙΜ |
| GR1430006 | ΟΡΟΣ ΟΘΡΥΣ, ΒΟΥΝΑ ΓΚΟΥΡΑΣ ΚΑΙ ΦΑΡΑΓΓΙ ΠΑΛΑΙΟΚΕΡΑΣΙΑΣ |
| GR1430007 | ΠΕΡΙΟΧΗ ΤΑΜΙΕΥΤΗΡΩΝ ΠΡΩΗΝ ΛΙΜΝΗ ΚΑΡΛΑΣ |
| GR1430008 | ΟΡΟΣ ΠΗΛΙΟ |
| GR1440002 | ΚΕΡΚΕΤΙΟ ΟΡΟΣ (ΚΟΖΙΑΚΑΣ) |
| GR1440003 | ΑΝΤΙΧΑΣΙΑ ΟΡΗ ΚΑΙ ΜΕΤΕΩΡΑ-ΣΠΗΛΑΙΟ ΜΕΛΙΣΣΟΤΡΥΠΑ |
| GR1440005 | ΑΝΤΙΧΑΣΙΑ ΟΡΗ ΚΑΙ ΜΕΤΕΩΡΑ |
| GR1440006 | ΚΟΡΥΦΕΣ ΟΡΟΥΣ ΚΟΖΙΑΚΑ |
| GR2430002 | ΟΡΗ ΑΓΡΑΦΑ |
Ιστοσελίδες Προγραμμάτων/Δράσεων της Μονάδας Διαχείρισης:
Ιστοσελίδα του πρώην Φορέα Διαχείρισης: